Pokémon nem sempre foi um desenho prefeito, este Anime, como também nos seus Jogos, recebeu muitas criticas e continua a recebe-las, algumas delas muito más, que até fizeram a Nintendo modificar algumas dessas coisas, tal como a pele do Brock nos jogos, alguns Sprites e outros...
Abaixo podem ver mais criticas.
- Muitas igrejas dos Estados Unidos, mas também de outros países,acreditam que Pokémons é uma série satânica.
- As Insígnias de Ginásio seriam talismãs mágicos que servem para controlar os Pokémons.
- As pedras mágicas, aquelas pedras usadas para evoluir Pokémons como o Pikachu e o Eevee entre outros, tornariam os Pokémons ainda mais demoníacos.
- Alguns Pokémons, como Murkrow ou Darkrai entre outros representam bruxas, fantasmas ou demónios.
- As criticas mais frequentes em Pokémons são as críticas relativas aos maus tratos de animais.
- O uso dos Pokémons para batalhas até a morte é malvisto no anime, apesar de apenas os vilões, como a Equipe Rocket, Magma, Aqua entre outros se baseiam nesse princípio mas sempre são interrompidos pelos heróis.
